承担全市地表水生态环境监管工作，拟订并监督实施全市重点流域生态环境规划和水功能区划，建立并组织实施水体交接断面水质考核制度，监督管理饮用水水源地生态环境保护工作，监督指导入江河排污口设置。承担海洋生态环境相关工作。承担全市大气、噪声、光、恶臭、化石能源、机动车等污染防治的监督管理工作。监督城市大气环境质量限期达标和改善情况。组织实施重污染天气应对政策措施。组织协调大气面源污染防治工作。承担长三角等区域大气污染联防联控工作。承担应对气候变化和温室气体减排工作。承担全市土壤、地下水等污染防治和生态保护的监督管理工作。组织实施农村生态环境保护，监督实施农业面源污染治理工作。承担全市固体废物、化学品、重金属等污染防治的监督管理工作，组织实施危险废物经营许可、固体废物转移许可、有毒化学品进出口登记、新化学物质环境管理登记等环境管理制度。承担全市辐射环境监管工作，监督管理核技术应用、电磁电离辐射和伴有放射性矿产资源开发利用中的污染防治工作。组织实施辐射环境质量监测和重点辐射源的监督性监测。承担核事故场外和辐射环境污染事故应急工作。承担排污许可综合协调和管理工作。承担污染物排放总量控制以及排污权交易综合协调和管理工作。组织污染源普查工作。