嵊州市农业科学研究所主要职责是：

（一）承担农业科学技术研究及试验工作。

（二）承担农作物新品种的引进和选育、农作物种质资源的保护、农业科技示范推广工作。

（三）承担农业科普教育、农业科技咨询和农业科技培训服务工作。

（四）开展农业广播电视学校学历教育和招生培训等相关工作。

（五）完成嵊州市农业农村局交办的其他任务。