嵊州市畜牧业发展中心主要职责是：

（一）承担实施畜牧业、水产养殖业、饲料业、兽医事业发展政策和规划计划的有关工作。

（二）承担畜牧兽医科技需求调查、科技成果转化和应用，组织实施畜禽、水产遗传资源保护和良种推广、畜牧业绿色生产等技术服务工作。开展畜牧兽医统计和信息化的具体工作。

（三）承担畜禽粪污资源化利用和病死畜禽无害化处理相关工作。

（四）承担饲料及饲料添加剂、兽药及兽药器械、生鲜乳生产收购运输环节质量安全监督管理的行政辅助工作。承担饲料及饲料添加剂、兽药和兽医器械行业技术推广相关工作。

（五）承担重大动物疫病的风险评估、预防、控制、和扑灭以及动物防疫应急处置等行政辅助工作，组织实施年度动物疫病防治工作计划的具体工作。

（六）承担动物检疫证章、票据及免疫标识管理和兽医从业人员管理等行政辅助工作。

（七）完成嵊州市农业农村局交办的其他任务。